Op. Dr. Faruk Gençoğlu Samsun 19 Mayıs Üniversitesinde başlamış olduğu tıp fakültesi kariyerini 2015 yılında İstanbul Cerrahpaşa Kardiyoloji Enstitüsü akademik kadrosuna girerek ihtisasını tamamlamıştır. Bu süreç boyunca yaklasık 3 bin vakada aktif olarak görev alan Gençoğlu; erişkin bypass cerrahisi, kalp kapakçık hastalıkları(aort-mitral-triküspit) aort cerrahisi, karotis cerrahisi, periferik damar hastalıkları, venöz yetmezlik(varis), derin ven trombozu gibi erişkin kalp ve damar hastalıkları cerrahisinde bulunmuştur. Ağırlıklı olarak kapalı kalp ameliyatlarında bulunmuştur. Ülkemizde sınırlı sayıda cerrah tarafından yapılan endoskopik(koltukaltı) kalp ameliyatlarını icra etmektedir. Ayrıca minimal invaziv(kapalı) bypass ameliyatları, küçük kesi kapakçık ameliyatlarını gerçekleştirmektedir. 2021 yılında Batman Eğitim ve Araştırma hastanesinde kalp cerrahisini tekrardan başlatan Gençoğlu kalp cerrahisi klinik şefi olarak görev yapmıştır. 2023 yılında İstanbul Çam ve Sakkura Şehir Hastanesinde kısa süreli görev alan Op. Dr. Faruk Gençoğlu Hisar Hospital Intercontinental Kalp ve Damar Cerrahisi bölümünde hastalarına hizmet vermektedir.